Il vaccino antinfluenzale può causare effetti indesiderati, in genere lievi e transitori, che compaiono entro i primi tre giorni e si risolvono in pochi giorni. I più comuni sono mal di testa, dolori muscolari, dolore nel punto di iniezione, febbre, brividi e stanchezza. Sono descritti anche rari casi di reazioni allergiche gravi e disturbi neurologici.
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